Президент України Віктор Янукович своїм указом № 154/2012 призначив Петра Шатковського першим заступником голови Служби безпеки України.
Текст документа розміщено на офіційному сайті глави держави.
Іншим своїм указом за № 153/2012 В.Янукович звільнив П.Шатковського з посади заступника голови Служби зовнішньої розвідки України.
За часів президентства Віктора Ющенко П.Шатковський був заступником глави секретаріату президента - уповноваженим з питань контролю за діяльністю Служби безпеки України.
Під час правління президента Леоніда Кучми, він був першим заступником глави СБУ.